1945年8月，中國人民經(jīng)過八年浴血奮戰(zhàn)，取得了抗日戰(zhàn)爭(zhēng)的偉大勝利。為了迅速恢復(fù)教育，南京開辦了三所國立臨時(shí)中學(xué)。南京五中的前身是國立第二臨時(shí)中學(xué)，于1945年10月籌建，12月1日開學(xué)。翌年8月，學(xué)校改歸市屬，更名南京市第五中學(xué)。1951年春，南京青年會(huì)中學(xué)并入南京五中。

    上世紀(jì)五十年代，學(xué)校遵循和貫徹陶行知先生的“平民教育”思想與“行知合一”理念，在教學(xué)中傾注對(duì)每個(gè)學(xué)生的關(guān)愛與幫助，注重理論聯(lián)系實(shí)際和啟發(fā)思維，大力開展各項(xiàng)學(xué)科活動(dòng)和文體活動(dòng)，取得了顯著的辦學(xué)成果。1953年學(xué)校被確定為江蘇省首批14所省級(jí)重點(diǎn)中學(xué)之一。1956年學(xué)校又被確定為全國實(shí)施“基本生產(chǎn)技術(shù)教育”的十所重點(diǎn)中學(xué)之一，并被列為對(duì)內(nèi)對(duì)外開放學(xué)校。1960年國家頒布《中學(xué)暫行條例》，南京五中被指定為“實(shí)行新計(jì)劃、新大綱、新教材”的試點(diǎn)學(xué)校，全校工作走上了以教學(xué)為中心、全面貫徹教育方針的正確軌道。

    改革開放以來，學(xué)校繼續(xù)堅(jiān)持正確的辦學(xué)理念，制定明確的奮斗目標(biāo)，加強(qiáng)教師隊(duì)伍建設(shè)，不斷完善學(xué)校管理，已把五中辦成一所擁有優(yōu)美校園環(huán)境、深厚文化底蘊(yùn)、高水平教師隊(duì)伍、優(yōu)良校風(fēng)校紀(jì)和出色教學(xué)質(zhì)量的重點(diǎn)中學(xué)。1997年初，南京五中再度進(jìn)入江蘇省重點(diǎn)中學(xué)行列。2005年初，學(xué)校被命名為江蘇省四星級(jí)普通高中。

    學(xué)校堅(jiān)持“推進(jìn)內(nèi)涵發(fā)展，打造精品高中”的目標(biāo)，教育教學(xué)質(zhì)量連年提高，形成了自己鮮明的辦學(xué)特色。

    五中辦學(xué)60多年來，為社會(huì)培養(yǎng)了數(shù)以萬計(jì)的各類人才。兩院院士、核物理學(xué)家喬登江、陳達(dá)，文學(xué)家周而復(fù)、余光中（臺(tái)灣），劇作家張弦、沙葉新，音樂家吳祖強(qiáng)、楊鴻年，澳大利亞工程院院士唐文華，北京市市長郭金龍、商務(wù)部副部長魏建國等都是五中校友。

    五中弘揚(yáng)“平民教育”思想，堅(jiān)持平等地對(duì)待每一個(gè)學(xué)生，從最后一名學(xué)生抓起，讓每個(gè)學(xué)生都有進(jìn)步，為學(xué)生的終身發(fā)展奠定基礎(chǔ)。

     五中有自己獨(dú)特的教師培養(yǎng)和發(fā)展機(jī)制。本校教師隊(duì)伍中先后成長出9名江蘇省特級(jí)教師，1名教授級(jí)高級(jí)教師。

    五中學(xué)生純樸，學(xué)風(fēng)濃厚；教師勤奮，教風(fēng)嚴(yán)謹(jǐn)。是我市中學(xué)最早的教科研項(xiàng)目中心。學(xué)校連續(xù)多年獲得“省文明單位”、“省教育先進(jìn)集體”、“省心理教育名校”、“雙無先進(jìn)學(xué)校”（無青少年犯罪，無侵害未成年人合法權(quán)益）、江蘇省首屆“和諧校園”、南京市“師德群體”等稱號(hào)。

     當(dāng)前，全校師生正滿懷熱情，在已取得成績(jī)的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步推進(jìn)素質(zhì)教育，深入開展課程改革和課堂教學(xué)改革，為把五中辦成全校師生愉快的學(xué)園、成長的樂園、溫馨的家園，辦成一所擁有科學(xué)教育理念、濃郁校園文化、鮮明辦學(xué)特色和優(yōu)秀教育質(zhì)量的精品獨(dú)立高中而奮斗。